1900年4月8日，侯德封出生于河北省高阳县河西村。童年学习努力，11岁入河北保定高师附小。13岁入保定育德中学。

1917年，考入北京大学预科。

1919年，进入北京大学地质系学习。

1923年，从北京大学地质系毕业后由于就业困难，改行到山东莱阳中学任教2年。

1924年—1925年，在山东莱阳县中学任教。

1926年—1927年，担任河南中原煤矿公司钻探师。

1928年—1935年，担任农矿部（实业部）地质调查所技士。

1936年—1937年，担任山西太原晋绥矿产测探局矿产课技正、课长。

1938年—1945年，担任四川省地质调查所技正。

1943年—1945年，担任四川省地质调查所所长，兼任重庆大学地质系教授。

1946年—1949年，担任南京中央地质调查所技正，兼陈列馆主任。

1950年，担任南京市人民政府委员。

1951年—1980年，担任中国科学院地质研究所所长。

1951年，担任中国地质工作计划指导委员会委员兼南京办事处主任。

1952年，加入九三学社。

1954年—1962年，担任中国地质学会书记、秘书长。

1955年，当选中国科学院学部委员（院士）。

1956年，加入中国共产党。

1958年，担任中国科学技术大学地球化学系系主任。

1968年—1980年，兼任中国科学院贵阳地球化学研究所所长。

1980年2月24日，在北京逝世。

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